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污水为基础的流行病学:污水监控来跟踪COVID-19

污水基础流行病学(WBE)或清沟监测是对废水进行分析,以确定是否存在生物制剂或化学品,以监测公共卫生。WBE以前被用于检测制药或工业废料、药物、病毒和潜在的耐抗生素细菌的出现。最近的研究表明,在废水中检测SARS-CoV-2冠状病毒可以成为追踪COVID-19疫情的一种低成本解决方案。

想了解更多关于方法的sewershed检测水中的病毒RNA?我们在这里帮助!

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废水中SARS-CoV-2检测:COVID-19早期预警系统

废水监测的最早报告跟踪COVID-19是由KWR水研究所在2020年三月他们发现SARS冠状病毒 - 2 RNA的废水样品在荷兰的存在的研究。该报告的COVID-19在国内被证实首例后,来到一个星期内。从那时起,一直使用WBE跟踪COVID-19的例子不胜枚举。

虽然WBE无法确定哪些人已被感染,但与患者检测相比,它有几个优势。

SARS-COV2水

污水监测的优点

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预先警告

SARS-COV-2 RNA可以在人体大便几天的症状出现之前检测到一个星期。一种研究表明污水监控可以预测,即使之前的个体病人的检测和住院COVID-19的爆发。

水图标人口

人口范围内的数据

一个废水样本可以提供数千人平均感染率的数据。这些汇总数据对于COVID-19临床检测率较低的地区尤其有用。

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低成本

而不是单独测试成千上万的病人,采集和检测少量的废水样本更具成本效益的获得人口范围内的数据。

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热门的工具

对废水的持续监测可用于确定当前疫情的趋势、确定新的疫情以及传染病的流行。

废水中的病毒检测:爆发预防的未来

目前,我们对传染病暴发的反应取决于在疫情已经发生后发现疾病。通过持续监测清沟水中的病毒,我们可以在潜在的暴发发生之前积极主动地加以识别。

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废水中冠状病毒RNA检测方案

  1. 样品采集

    污水中的病毒检测从收集下水道的废水样本开始,在那里,水流入污水系统的单一点。

  2. 巴氏灭菌法

    所收集的废水样品在60℃下巴氏灭菌,以灭活任何活病原体。

  3. 病毒的浓度

    该病毒是使用一个集中聚乙二醇8000沉淀、离心过滤或超离心法。

  4. RNA提取

    提取方法(手动,自动化高通量)用于从浓缩的病毒物质中纯化病毒RNA。

  5. RNA定量

    RNA被量化,以确保输入RNA的适当数量和质量被用于下游分析。

  6. RT-qPCR放大

    RNA反转录为cDNA,并使用引物组或者核衣壳基因(N1 / N2)或包膜基因(E)通过定量PCR扩增。

  7. 数据分析

    结果进行了分析,并采集的区域内的病毒载量的持续的水平进行比较。

参见废水样本中检测SARS-CoV-2 RNA的详细方案。


从废水精矿PEG 8000沉淀法制备病毒分离纯化

下载协议

离心过滤制备的废水浓缩物的病毒纯化

下载协议

COVID-19污水检测产品

病毒RNA提取

下面麦克斯韦®建议使用核酸纯化试剂盒从废水样本中提取病毒RNA。这些试剂是麦克斯韦使用的®仪器允许在每次运行高达48个样品的自动化从废水中的病毒RNA的提取。

净化规模化和自动化支持

我们的现场支持科学家可以帮助您实现或病毒RNA提取方法优化的自动化,无论所使用的仪器平台。我们将帮助您开发满足您的特定需求的工作流程!

学到更多

病毒RNA定量

该QuantiFluor®RNA系统包含一种荧光RNA结合染料,可对溶液中的少量病毒RNA进行敏感定量,并优化用于紧凑型双通道Quantus™荧光计。

SARS-CoV的-2 RNA的扩增

PCR试剂,包括qPCR和RT-qPCR产物,通常用于检测和扩增靶病毒序列。的GoTaq®探针1步RT-qPCR系统对于疾病预防中心与预防中心(CDC)推荐预混选项2019-新型冠状病毒实时RT-PCR诊断面板。

我们正在开发专门用于废水样品的扩增试剂盒。如需更多信息,请联系我们applied@promega.com

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阅读废水由KWR水研究所SARS-COV-2病毒RNA检测的第一份报告。

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SARS-COV-2在废水回顾

本文综述了废水中SARS-CoV-2检测的研究现状和研究需求。

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